刺殺曼蘇爾，無可避免令美國和巴基斯坦的關係惡化。巴基斯坦一直否認他在境內受到軍方情報機關庇護，如今美軍脫離巴國一直默許的空襲地區刺殺他，事前又沒通報伊斯蘭堡，明剃巴國眼眉。
過去，美國在巴基斯坦近阿富汗邊境地區的無人機空襲，均交由中情局負責，採取低調秘密行動，盡量免令巴國尷尬，空襲差不多全在聯邦直轄部落地區的南北瓦濟里斯坦進行。但今次刺殺曼蘇爾卻是由美軍執行，空襲地點艾哈邁德瓦爾在較南的俾路支省，相信是美國首次在該省行動，五角大樓事後還高調發表聲明，完全不留情面給巴基斯坦。
外界相信曼蘇爾有巴國軍方撐腰，伊斯蘭堡一直聲稱以懷柔手段，游說塔利班參與和談，但為解決阿富汗衝突而舉行的中、美、阿、巴四方會談，前後五輪塔利班都拒派代表出席，美國和阿富汗卻對巴國的包庇非常不滿。
今次美國深入巴國空襲，顯然是要告訴伊斯蘭堡，華府的忍耐已經到了極限。但亦有分析指巴方同意，若塔利班堅拒和談，會對美軍行動採取合作態度，所以默許這次空襲。
英國《觀察家報》